Située dans la zone nord-est de la Communauté de Madrid, Algete se trouve à environ 30 kilomètres de la capitale, entre les vallées des rivières Jarama et Guadalix. Elle est entourée de paysages vallonnés typiques du plateau castillan, avec des vues dégagées sur la campagne.
La commune est proche de villes comme San Sebastián de los Reyes, Alcobendas et Madrid, ce qui lui permet de bénéficier de leurs services tout en conservant une identité plus calme et résidentielle. Le fleuve Jarama borde une partie du territoire et constitue un axe naturel important dans la région.
Le climat est méditerranéen continental, avec des étés chauds et secs et des hivers froids, souvent venteux. Le printemps et l’automne sont des saisons particulièrement agréables pour visiter la ville, faire des activités de plein air ou organiser des événements.