Colmenarejo est accessible depuis Madrid en voiture en moins de 40 minutes via la M-505. Des lignes de bus interurbains relient la ville à Madrid (station Moncloa) ainsi qu’aux communes voisines, facilitant les déplacements quotidiens ou touristiques.
La ville ne dispose pas de gare ferroviaire propre, mais la station la plus proche se trouve à Galapagar-La Navata, accessible en bus. De là, les trains de Cercanías permettent de rejoindre rapidement Madrid.
En ce qui concerne les transports internes, Colmenarejo reste une commune de petite taille où il est facile de se déplacer à pied ou à vélo. Les infrastructures routières sont bonnes, et le stationnement est généralement facile dans le centre-ville.