Située à seulement 20 kilomètres au nord de Madrid, San Sebastián de los Reyes fait partie de la couronne métropolitaine madrilène. Elle est bordée à l’ouest par Alcobendas, avec laquelle elle forme un pôle urbain très intégré, et bénéficie d’un accès rapide à l’autoroute A-1, l’une des principales artères vers le nord de l’Espagne.
La ville est installée sur un terrain légèrement vallonné, entre les contreforts de la Sierra de Guadarrama et les plaines centrales de Castille. Bien qu’urbaine, elle est proche de la nature grâce à des parcs protégés, comme le Parque Regional de la Cuenca Alta del Manzanares, accessible en voiture.
Le climat est méditerranéen continental, avec des étés chauds et secs et des hivers froids mais ensoleillés. Le printemps et l’automne sont des saisons idéales pour visiter la ville et organiser des événements en extérieur, profitant d’une météo douce et stable.