Beniaján est située dans le sud-est de l’Espagne, dans la région de Murcie, à environ 5 km au sud-est de la ville de Murcie. Elle fait partie de la Comarca de la Huerta de Murcia, l’une des zones agricoles les plus riches du pays, arrosée par le fleuve Segura et ses affluents.
Le territoire de Beniaján est bordé par les Sierras de Miravete et de Columbares, formant une transition douce entre la plaine fertile et les premiers reliefs de la région. Ce positionnement permet de belles escapades dans la nature et une vue panoramique sur les vergers d’agrumes.
Le climat est méditerranéen semi-aride, avec plus de 300 jours de soleil par an. Les étés sont chauds et secs, les hivers doux. Le printemps et l’automne sont les périodes idéales pour visiter la ville, notamment pour ses sentiers naturels et ses festivals.