L’économie de Santa María de Cayón repose principalement sur l’agriculture, l’élevage et les services liés au tourisme rural. L’élevage bovin laitier est particulièrement développé, fournissant des produits laitiers de haute qualité à toute la région. La production artisanale y est également vivante, notamment dans la fabrication de fromages, de conserves et de produits à base de viande.
La présence de l’usine Nestlé à La Penilla, l’une des plus anciennes du groupe en Espagne, constitue un pôle économique important qui offre de nombreux emplois et contribue à la stabilité de la commune. Le commerce local est concentré autour de Sarón, où se trouvent supermarchés, restaurants, petites entreprises et marchés hebdomadaires.
Le développement du tourisme rural et écoresponsable est en plein essor, avec de plus en plus d’hébergements en gîtes, d’activités de nature, et d’initiatives locales visant à promouvoir un tourisme doux et durable. C’est un modèle économique en croissance qui attire aussi les jeunes entrepreneurs.