San Juan de Alicante est une ville dont l’économie repose sur plusieurs piliers : la santé, l’éducation, le tourisme, et les services. La présence de l’Hôpital Universitaire de San Juan, l’un des plus importants de la province, fait de la ville un pôle de référence en matière de santé et de recherche.
L’université Miguel Hernández y possède également une antenne, et plusieurs établissements privés d’enseignement supérieur y sont implantés, contribuant à une population étudiante stable. Le secteur immobilier y est aussi en développement, attirant des résidents permanents venus d’Espagne ou de l’étranger.
Le tourisme reste important, notamment en été, grâce à la proximité de la plage et à la qualité des infrastructures. Le commerce de proximité, les cafés, restaurants, marchés et services à la personne complètent le tissu économique local.