Mérida è ben collegata grazie a una rete efficiente di treni e strade. La stazione ferroviaria offre collegamenti diretti con Badajoz, Cáceres, Madrid e Siviglia. L’aeroporto più vicino è quello di Badajoz (circa 50 minuti in auto), con collegamenti nazionali, mentre l’aeroporto di Siviglia offre opzioni internazionali più ampie.
La città è attraversata dall’autostrada A-5, che collega Madrid con Lisbona, rendendo Mérida facilmente accessibile anche in auto. I pullman regionali e nazionali servono bene la città e rappresentano un’opzione economica per spostarsi.
All’interno della città, il trasporto pubblico è garantito da una rete di autobus urbani e taxi. Tuttavia, grazie alle dimensioni compatte del centro storico, molti spostamenti possono essere fatti comodamente a piedi o in bicicletta, permettendo di esplorare il patrimonio archeologico con facilità.