Santoña ha una popolazione di circa 11.000 abitanti, con una struttura demografica equilibrata e una presenza crescente di residenti stranieri, soprattutto provenienti da altri paesi europei attratti dalla qualità della vita e dalla tranquillità della zona.
La popolazione è composta da una forte componente locale con radici profonde nel territorio, con una notevole percentuale di persone impiegate nel settore della pesca, della trasformazione alimentare e dei servizi turistici.
Negli ultimi anni si è assistito a un lieve incremento della popolazione durante i mesi estivi, grazie al turismo stagionale e ai ritorni di emigrati che mantengono case di famiglia in città.