Peñarroya-Pueblonuevo è ben collegata alle principali città andaluse tramite una rete di strade statali e regionali. Sebbene non disponga di un aeroporto proprio, è facilmente raggiungibile dagli aeroporti internazionali di Córdoba (circa 1 ora e 30 minuti di macchina) e Siviglia (circa 2 ore).
La stazione ferroviaria della città collega Peñarroya-Pueblonuevo alla rete regionale Renfe, consentendo collegamenti con Córdoba e altre destinazioni. Esistono anche servizi regolari di autobus che la collegano con i centri abitati circostanti.
All’interno della città, il trasporto è principalmente basato su mezzi privati, ma esistono servizi di taxi e piccoli autobus urbani che facilitano la mobilità. La dimensione contenuta del centro urbano consente comunque spostamenti agevoli anche a piedi o in bicicletta.