Puente-Genil è ben collegata al resto della Spagna grazie alla sua posizione strategica. La città dispone della stazione AVE “Puente Genil-Herrera”, parte della rete ferroviaria ad alta velocità spagnola, che consente di raggiungere facilmente città come Córdoba, Málaga e Siviglia in meno di un’ora.
Per chi viaggia in auto, l’accesso è semplice grazie alla vicinanza con le autostrade A-45 e A-92. Gli autobus regionali collegano regolarmente la città con i principali centri andalusi. L’aeroporto più vicino è quello di Málaga, situato a circa 100 km, seguito da quelli di Sevilla e Córdoba.
All’interno della città, il trasporto pubblico è gestito da una rete di autobus urbani e taxi, ma molti visitatori preferiscono esplorarla a piedi, data la sua dimensione contenuta e l’atmosfera rilassata. I parcheggi sono facilmente disponibili e le piste ciclabili stanno progressivamente migliorando la mobilità sostenibile.