Lepe è facilmente raggiungibile grazie alla vicinanza con le principali vie di comunicazione dell’Andalusia. L’aeroporto più vicino è quello di Faro (Portogallo), a circa un’ora di distanza, seguito dall’aeroporto di Siviglia. Entrambi offrono collegamenti internazionali e nazionali.
La città è servita da autobus regionali che la collegano con Huelva, Siviglia e altre località costiere. La stazione ferroviaria più vicina si trova a Huelva, da cui è possibile raggiungere Lepe in auto o bus. La rete stradale è ben sviluppata, con accesso diretto tramite l’autostrada A-49.
All’interno della città, i trasporti pubblici sono efficienti e l’ambiente urbano è facilmente percorribile a piedi o in bicicletta. Le infrastrutture moderne garantiscono un buon livello di accessibilità anche per persone con mobilità ridotta.