Antequera è ben collegata con il resto della Spagna grazie alla sua posizione centrale e alle ottime infrastrutture. La città dispone di due stazioni ferroviarie: Antequera-Ciudad e Antequera-Santa Ana, quest’ultima servita dall’alta velocità (AVE), che la collega a Madrid, Málaga e Siviglia in tempi rapidi.
L’aeroporto internazionale di Málaga si trova a circa 45 minuti in auto ed è servito da voli provenienti da tutta Europa. Anche l’autostrada A-45 collega rapidamente Antequera con la costa e le altre principali città andaluse.
All’interno della città, il sistema di trasporto urbano è efficiente e copre tutte le aree principali. Tuttavia, grazie alle dimensioni contenute del centro storico, è possibile visitarlo comodamente a piedi o in bicicletta.