L’economia di Nerja è fortemente basata sul turismo, che rappresenta la principale fonte di reddito. La bellezza paesaggistica, le attrazioni culturali e il clima favorevole attirano visitatori da tutta Europa, in particolare dal Regno Unito, dalla Germania e dai paesi nordici.
L’agricoltura continua a svolgere un ruolo importante, soprattutto con la coltivazione di canna da zucchero, avocado, mango e altri frutti tropicali grazie al microclima favorevole della zona.
In città si trovano numerose piccole imprese artigianali, negozi di prodotti locali e un mercato settimanale molto frequentato. Inoltre, l’immobiliare è in espansione, grazie alla crescente domanda di seconde case o residenze permanenti da parte di stranieri.