San Juan de Aznalfarache è facilmente raggiungibile grazie alla sua eccellente rete di trasporti. L’aeroporto di Siviglia (Aeropuerto de Sevilla-San Pablo) dista solo circa 20 minuti in auto e offre collegamenti nazionali e internazionali.
La città è servita dalla metropolitana di Siviglia, con due stazioni principali (San Juan Alto e San Juan Bajo) che consentono un accesso rapido e diretto al centro della capitale. Inoltre, diverse linee di autobus collegano San Juan con Siviglia e le città vicine.
All’interno di San Juan de Aznalfarache, muoversi è semplice e comodo grazie alla presenza di taxi, piste ciclabili e un sistema urbano ben organizzato, ideale per visitatori e residenti.