Guernica y Luno è facilmente raggiungibile in treno grazie alla linea Bilbao-Bermeo operata da Euskotren, con frequenti collegamenti giornalieri. Dalla stazione ferroviaria si può arrivare comodamente al centro città a piedi.
In auto, la città è ben collegata tramite la strada BI-635 e l’autostrada AP-8. L’aeroporto più vicino è quello di Bilbao, a circa 30 minuti di distanza in auto, che offre collegamenti nazionali e internazionali.
All’interno della città, il trasporto pubblico è garantito da autobus locali, ma viste le dimensioni contenute del centro urbano, la maggior parte degli spostamenti può essere effettuata a piedi o in bicicletta.