L’economia di Pájara si basa prevalentemente sul turismo, che rappresenta la principale fonte di reddito per la popolazione locale. L’ospitalità, i servizi turistici, i trasporti e le attività ricreative sono settori in continua espansione.
L’agricoltura e la pesca, pur avendo perso parte del loro peso economico, sono ancora presenti e contribuiscono a mantenere vive le tradizioni e i prodotti locali. Si producono formaggi caprini artigianali, molto apprezzati anche al di fuori delle isole.
Il commercio al dettaglio e l’artigianato locale – in particolare ceramiche, tessuti e prodotti di palma intrecciata – aggiungono ulteriore valore all’offerta turistica e culturale della città.