Pájara è facilmente raggiungibile grazie alla vicinanza con l’Aeroporto di Fuerteventura (FUE), situato a circa 80 km di distanza. L’aeroporto è ben collegato con le principali città spagnole ed europee.
All’interno del comune, il trasporto pubblico è garantito da una rete di autobus (operata da Tiadhe) che collega le principali località come Morro Jable, Costa Calma e La Pared. Il noleggio auto è molto diffuso e consigliato per esplorare al meglio l’intera zona.
La città è dotata di strade ben mantenute e infrastrutture turistiche moderne, il che rende gli spostamenti semplici e piacevoli sia per i residenti che per i visitatori.