L’economia di Alcázar de San Juan è diversificata, con un forte peso dell’agricoltura, in particolare la viticoltura. La città fa parte della Denominazione di Origine La Mancha, ed è sede di cantine prestigiose che producono vini di qualità esportati in tutto il mondo.
Anche il settore dei servizi e del commercio è ben sviluppato, con una rete di piccole e medie imprese attive nei settori alimentare, turistico e artigianale. Il turismo, sia culturale che enogastronomico, rappresenta un settore in crescita.
Inoltre, la città ha un’importanza logistica e industriale a livello regionale, grazie alla sua posizione centrale e alla presenza di infrastrutture ferroviarie e stradali efficienti.