Miranda de Ebro è facilmente raggiungibile grazie alla sua posizione su importanti vie di comunicazione. È servita da una stazione ferroviaria che collega la città con Madrid, Bilbao, Burgos, Vitoria-Gasteiz e Logroño, rendendola accessibile da tutto il paese.
Le autostrade A-1 e AP-68 passano nei pressi della città, facilitando gli spostamenti su strada. Gli aeroporti più vicini sono quelli di Vitoria (a circa 35 km), Bilbao (a circa 100 km) e Burgos (a circa 90 km), tutti ben collegati tramite autostrada e mezzi pubblici.
All’interno della città, il sistema di trasporto urbano è efficiente, con linee di autobus che coprono tutti i quartieri principali. Il centro storico è facilmente percorribile a piedi o in bicicletta, grazie a percorsi pedonali e piste ciclabili.