L’economia di Bayona è fortemente legata al turismo, che rappresenta la principale fonte di reddito grazie alla bellezza del territorio e alla ricchezza culturale. La città si anima durante l’estate con migliaia di visitatori che affollano le spiagge, i locali e gli eventi.
Oltre al turismo, la pesca artigianale e l’acquacoltura sono settori ancora presenti, con un mercato del pesce attivo e ristoranti che offrono frutti di mare freschissimi. Anche l’artigianato locale, soprattutto la lavorazione della ceramica e dei tessuti, rappresenta una nicchia economica interessante.
Il commercio e i servizi, soprattutto legati all’accoglienza turistica, come hotel, B&B, agenzie di escursioni e ristoranti, costituiscono un altro importante motore economico per la cittadina.