L’economia di Alcalá de Henares è diversificata e dinamica. Il settore dei servizi, in particolare quello legato al turismo culturale, all’istruzione e alla sanità, costituisce la spina dorsale dell’economia cittadina. L’Università e i suoi numerosi studenti, docenti e ricercatori danno un impulso costante all’economia locale.
Il settore industriale è presente nelle aree periferiche, dove operano aziende nei settori della logistica, produzione alimentare, componentistica elettronica e automotive. L’artigianato locale, soprattutto nel campo della ceramica, della carta e del legno, mantiene viva una tradizione secolare.
Un altro aspetto importante è la presenza di centri commerciali e mercati tradizionali che alimentano l’economia quotidiana. Alcalá è anche sede di numerosi eventi fieristici e congressuali che attraggono professionisti da tutta la Spagna.