San Agustín de Guadalix è facilmente raggiungibile grazie alla sua posizione lungo l’autostrada A-1 (Madrid-Burgos). La città dista meno di 30 minuti in auto dal centro di Madrid, ed è servita da diverse linee di autobus interurbani che collegano quotidianamente con la capitale.
Nonostante non abbia una stazione ferroviaria propria, le stazioni vicine (come quella di Tres Cantos) sono facilmente accessibili e permettono di raggiungere rapidamente altri centri urbani importanti. Gli aeroporti più vicini sono l’Aeroporto Adolfo Suárez Madrid-Barajas (a circa 30 km), con collegamenti internazionali e nazionali.
All’interno della città, gli spostamenti sono semplici e veloci grazie alle dimensioni contenute del centro urbano. Piste ciclabili, parcheggi gratuiti e percorsi pedonali ben segnalati rendono la mobilità comoda anche per i visitatori.