L’economia di San Fernando de Henares è tradizionalmente legata al settore industriale e logistico. La sua posizione privilegiata, vicino alle grandi vie di comunicazione e all’aeroporto di Madrid-Barajas, ha favorito lo sviluppo di poli logistici e di aziende legate al trasporto e alla distribuzione.
Il settore dei servizi è in crescita, in particolare commercio, ristorazione, assistenza e attività culturali. Le piccole e medie imprese locali offrono una varietà di prodotti e servizi che contribuiscono all’economia urbana. Anche il settore immobiliare ha visto uno sviluppo grazie alla crescente attrattività della zona come residenza per lavoratori e famiglie.
Un elemento distintivo è la presenza di cooperative agricole e mercati locali che promuovono la filiera corta e la produzione sostenibile, molto apprezzati sia dai residenti che dai visitatori.