L’economia di Molina de Segura è storicamente legata all’agricoltura, grazie alla fertilità delle sue terre irrigate dal fiume Segura. La produzione di frutta, ortaggi e in particolare l’industria della trasformazione alimentare rappresentano ancora oggi un pilastro economico.
Negli ultimi decenni, la città ha vissuto una forte espansione industriale, specialmente nei settori della logistica, del packaging e della produzione alimentare. Sono presenti numerosi poli industriali moderni che ospitano imprese locali e multinazionali.
Molina è anche un centro commerciale rilevante nell’area, con mercati settimanali, centri commerciali e una fitta rete di piccole e medie imprese. Il settore dei servizi è in crescita, così come l’interesse per il turismo rurale ed enogastronomico.