Molina de Segura è ben collegata grazie alla vicinanza alla città di Murcia, da cui dista solo 10 km. L’aeroporto internazionale Región de Murcia si trova a circa 40 minuti in auto, mentre l’aeroporto di Alicante-Elche, più grande, è a poco più di un’ora.
La città è attraversata dall’autostrada A-30, che la collega direttamente a Murcia, Cartagena e Albacete. È servita anche da linee ferroviarie regionali e da una rete di autobus interurbani molto efficiente.
Il trasporto urbano è assicurato da un servizio di autobus locali che copre tutti i quartieri principali, facilitando gli spostamenti all’interno del comune. Le dimensioni contenute della città permettono anche di muoversi agevolmente a piedi o in bicicletta.