Santa María de Cayón è facilmente accessibile sia dalla costa che dall’entroterra. L’aeroporto più vicino è quello di Santander, a circa 25-30 km di distanza, collegato con le principali città spagnole ed europee. Da lì, la città è raggiungibile in auto o tramite autobus regionali.
Il comune è servito da una rete di strade ben mantenute e si trova a breve distanza dall’autostrada A-8, che collega tutto il nord della Spagna. Per chi viaggia in treno, la stazione ferroviaria più vicina è quella di Sarón, frazione del comune, collegata alle linee regionali.
All’interno del territorio comunale, gli spostamenti sono facili grazie a una viabilità agevole e a una buona disponibilità di parcheggi. I collegamenti tra le frazioni sono garantiti da autobus locali.